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收藏概述
在NGS靶向捕获过程中,利用接头Blocker封阻文库接头序列,可以阻止文库接头之间的结合;Cot-1 DNA可封阻文库插入片段高拷贝区域/低序列复杂度区域,阻止探针通过交叉杂交而造成的非特异性地抓取这类区域。通过显著减少这两种非特异性结合的情况,可提高中靶率和数据利用率。迪赢生物为Illumina和MGI平台靶向捕获流程设计了接头封阻试剂,并提供单独的人类Cot-1 DNA,支持多样本杂交,保障用户的捕获效率。
主要优势
● 优异的封阻效果
通过封阻多种接头序列和基因组高拷贝区域/低序列复杂度区域,有效减少不同文库分子之间的非特异性结合,提升捕获效率
● 灵活的搭配方案
提供适配illumina和MGI等不同测序平台、单杂和多杂等不同技术流程的试剂,满足不同实验需求
● 科学的成本控制
通用封闭液可封闭多杂文库,同时可提供单杂版本封闭液,降低每个样本的试剂成本
封闭示意图

数据
在不同大小panel上的封闭效果

图1. QuarAcces Universal Blocker with cot-1和竞品在不同大小panel上的封阻效果
注:Input 100 ng标准品(NA24385)进行超声DNA建库,每个测试采用750 ng构建好的文库,使用迪赢和不同厂家封闭液,进行常规杂交捕获(QuarHyb One Reagent Kit,Dynegene,NC1003)。捕获探针为10gene(QuarXeq NCCN Cancer Panel 1.0 ,Dynegene, NY1016,88kb)及WES 3.0(QuarXeq Human All Exon Probes 1.0,Dynegene,NY1001,41.5Mb)探针分别进行捕获,illumina平台上机测序。结果显示不同大小Panel捕获时,迪赢封闭液封阻效果略优于竞品或与竞品相当。
在不同总量文库上的封闭效果

图2. QuarAcces Universal Blocker with cot-1在不同总量文库上的封阻效果
注:制备多个双端Pre-index文库,每个文库分别取500ng进行混合,混成总量3ug,6ug,9ug的文库,分别进行10gene RNA探针( QuarXeq NCCN Cancer Panel 1.0 ,Dynegene, NY1016)的过夜杂交捕获(QuarHyb One Reagent Kit,Dynegene,NC1003),illumina平台上机测序,结果显示迪赢封闭液对不同总量文库的封阻表现均优异且稳定。
封闭液对不同平台的封闭效果

图3. QuarAcces Universal Blocker with cot-1(illumina平台)和竞品的封阻效果比较

图4. QuarAcces Universal Blocker with cot-1 for MGI Dual和竞品的封阻效果比较
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