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单细胞核 RNA 测序
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伯豪生物单细胞核转录组测序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是从组织抽提细胞核,然后在单个细胞核水平上对转录组进行高通量测序分析的一项新技术,通过检测单个细胞核的基因表达状态,进而揭示细胞间的异质性。
技术服务 研发实验室
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品牌 SHBIO
地区 中国,上海,上海市
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产地 国产
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伯豪生物
上海伯豪生物技术有限公司
上海市浦东新区张江镇李冰路151号
营业执照已审核
上海伯豪生物技术有限公司(简称:伯豪生物,英文名:Shanghai Biotechnology Corporation)2008 年 12 月成立,是生物芯片国家工程研究中心的有机组成部分,专注于提供专业的生物医药和疾病诊断创新技术、产品和优质服务。 伯豪生物自成立以来获得了国家基因检测技术应用示范中心、国家工信部专精特新“小巨人”企业、院士专家工作站、高新技术企业、上海市研发公共服务平台(负责“上海市高通量疾病标志物服务平台”和“上海市基因芯片专业服务平台”的运营)、上海市服务外包公共平台、上海科技小巨人企业、浦东新区企业研发机构、联合实验室建设等一系列资质,拥有医疗机构执业许可证、医疗器械经营许可证。 伯豪生物于 2016 年入选国家发展和改革委员会首批基因检测技术应用示范中心,与复旦大学附属肿瘤医院、上海市胸科医院、上海市儿童医院、上海生物信息技术研究中心等单位共同承担运行“高发肿瘤及遗传性疾病基因检测示范中心”。 伯豪生物建立了规范化的质量控制体系,通过了 ISO9001:2015 质量技术体系的认证,并参照 GLP- L 的标准,通过 156 个 SOP 文件对项目、样品、实验过程、生物信息分析过程、数据信息管理、保密等进行严格质控。 伯豪生物自成立以来累计技术服务 15 年有余,承接项目数超 50000 个,用户单位 5000 家以上,累计处理样品超过 30 万份,协助客户发表论文 2500 余篇,总影响因子(IF)超 18000 分,平均影响因子(IF)大于 7.2 分。全面推动中国基因组学服务产业发展。可靠的质量已经得到了国内及国际科研领域的认可!伯豪生物秉承着“服务科技创新,护航人类健康!”的使命,为每一位伯豪生物客户提供专注、专业、高效的科研技术服务。 伯豪生物经过十多年不断投入和持续打造,伯豪生物已经成长为一家硬件精良,人才合理,技术专业,管理规范,理念先进,符合国际标准的以技术开发和技术服务见长的生物技术公司。
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SHBIO
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技术简介

伯豪生物单细胞核转录组测序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是从组织抽提细胞核,然后在单个细胞核水平上对转录组进行高通量测序分析的一项新技术,通过检测单个细胞核的基因表达状态,进而揭示细胞间的异质性。

实验流程
 

伯豪生物单细胞核转录组测序科研流程图

冷冻样本和难消化样本的解决方案

1、适用于冻存组织样品;克服新鲜样品时效性限制;

2、适用于难以制备单细胞悬液的组织样品;

3、减少解离偏差,能更好地保留细胞类型多样性;

4、不需要酶促消化,真实反映细胞的组分。

伯豪优势

1、高质量抽核:抽核经验丰富,针对不同组织优化了解决方案;

2、标准化内控:丰富的实操经验构建了标准化的内控体系;

3、流程化分析:完善的分析流程,准确快速解析单细胞核转录组数据;

4、专业的团队:专业的技术团队具有多年项目方案设计、实验操作、售后分析等经验;

5、全流程服务:提供组织抽核、单细胞核捕获、反转录、建库测序及数据分析的全套服务。

样本要求

1、组织用量:黄豆粒大小 1 块;

2、样本处理:组织液氮速冻,-80℃保存;

3、质量要求:组织 RNA 无降解,RIN≥7;

4、运输方式:干冰运输。

应用领域

冷冻样本;FFPE 样本; 通过消化难拿到高质量的单细胞悬液的组织类型。

研究成果
 

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 1

                                                                   小鼠肝脏单细胞核

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 2

                                                                   人松果体单细胞核

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 3

                                                             小鼠大脑皮层单细胞核

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 4

                                            小鼠心脏组织细胞核 RNA 质检(RIN=8.9)

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 5

                                       PCR 验证组织与细胞核、组织与消化细胞的差别(0 为相同)

结论:

小鼠大脑皮层,相比于消化细胞,细胞核的表达情况更接近于原始组织样本。

【单细胞转录组测序】VS【单细胞核转录组测序】结果对比

1、随着测序深度的不断增加,单细胞核转录组测序(snRNA-seq)和单细胞转录组测序(scRNA-seq)得到的基因数相近。

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 6

                                                          Single-cell DropSeq scDropSeq

2、单细胞核转录组测序在细胞分群上与单细胞转录组测序没有区别

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 7
 

                 单细胞核数据分群结果                                                       单细胞转录组数据分群结果

3、单细胞核转录组测序可有效挖掘稀有细胞类型

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 8

                                        单细胞核转录组测序可以减少组织消化引起的偏差

4、单细胞核转录组测序结果中发现较少压力相关基因的表达

伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 9
 

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