核糖核酸酶R (Ribonuclease R，RNase R) 来源于大肠杆菌RNR超家族，是一种镁离子依赖性的3'—5'核糖核酸外切酶，可从3'—5'方向将RNA逐步切割成二核苷酸和三核苷酸。RNase R几乎能够消化所有线性的RNA，但不易消化环状RNA、套索结构RNA和3'端突出少于7个核苷酸的短双链RNA分子。  RNase R常用于基因表达和可变剪切研究，可消化线性RNA以富集环状RNA或套索结构RNA。