对于96孔板，按照每孔使用100μl染色液计算，本试剂盒可以进行500次检测；如果用于流式细胞仪检测，按照每个样品的检测体系体积为0.5ml时，本试剂盒可以进行100次检测；对于6孔板中的贴壁培养细胞样品，按照每孔使用1ml染色液计算，本试剂盒可以进行50次检测。
由于Mito-Tracker Green对于线粒体的染色不依赖于线粒体膜电位，因此可对固定后的细胞或组织进行染色，但荧光可能会有一定程度的下降或弥散；而活细胞染色后，再经过固定后会导致荧光消失。本试剂盒适用于荧光显微镜、激光共聚焦显微镜、流式细胞仪等荧光检测设备。本试剂盒也可用于固定细胞的线粒体染色，但染色效果会略有下降。本试剂盒不建议染色后再进行固定。