深层过滤系统主要是用于生物制品制备过程中大型细胞颗粒杂质的去除，如细胞澄清（生物反应间）或中间品过滤过程（纯化间）中。该系统主要是由动力单元、膜包夹持夹具、检测单元、自控单元等构成。

深层过滤夹具用于夹持一级或两级一定面积的深层过滤膜包，通过动力泵让料液通过深层过滤膜包，对料液中的固体颗粒杂质截留达到澄清的目的。卧式的夹具设计使得膜包在横向堆叠安装方式下可以很好的保持水平以降低残留面积并避免气锁现象。