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收藏在过去几十年中,各种药物类型被引入或广泛应用,以提高药物疗效、安全性和药物代谢动力学(DMPK)特性,或用于发现针对新靶点的药物。这些药物形式包括肽、寡核苷酸、蛋白水解靶向嵌合体(PROTACs)、抗体 - 药物偶联物(ADCs)、肽药物偶联物(PDCs)、放射性核素药物偶联物(RDCs)、小分子药物偶联物(SMDCs)、抗体 - 肽偶联物(APCs)、抗体 - 寡核苷酸偶联物(AOCs)和降解剂 - 抗体偶联物(DACs)。其中一些治疗模式已成为许多生物技术和制药公司重要的研发管线资产。然而,大多数新药物模式的代谢途径与小分子药物显著不同。因此,常用于检测 I 相和 II 相代谢物的 LC - HRMS 数据处理工具(如 EIC 和 MDF),并不适用于分析大多数新药物模式的代谢物。另一方面,大多数为分析和鉴定肽及寡核苷酸代谢物而开发的软件工具,无法找到氧化代谢物和结合物。
为应对各种药物模式生物转化研究的新挑战和需求,XenoFinder 开发了几种新颖的 LC - HRMS 工作流程,用于分析由蛋白质分解、肽和寡核苷酸水解、I 相和 II 相代谢及其组合产生的代谢物。这些工作流程充分利用了背景扣除过滤器和肽 / 寡核苷酸代谢物鉴定软件工具的工作机制。例如,我们开发了一种通用的 LC - HRMS 方法,用于鉴定含肽治疗药物的代谢物,这些代谢物通过肽水解和 I 相及 II 相代谢反应形成。