已关闭
收藏| 简述 | 蛋白质组学是指大规模地对蛋白质水平、翻译后修饰、蛋白质相互作用等进行研究。蛋白质组研究不仅可以全面的解释生命活动的分子本质,还能阐释生命在生理或病理条件下的变化机制。在寻找蛋白质通路中的关键蛋白,临床样本中的药物靶标和诊断生物标志物中起到了至关重要的作用。 |
| 适用范围 | 蛋白质通路分析、药物靶标筛选、功能域鉴定及诊断用生物标志物确定。 |
| 简述 | 培养了CHO-K1细胞系,对培养上清进行了外泌体分离并用电镜鉴定了结果,同时运用质谱法对CHO-K1细胞的无血清培养上清蛋白质和外泌体蛋白质进行定性鉴定,通过对质谱结果的生信分析建立了CHO-K1细胞无血清培养上清蛋白和外泌体蛋白数据集。 |
| 实验流程 | 将CHO-K1细胞驯化至无血清培养基中,应用膜亲和结合分离柱提取其中的外泌体并进行鉴定。提取培养上清和外泌体中的蛋白,运用nanoLC-ESI-MS-MS技术进行鉴定,对鉴定到的蛋白质进行基因本体论注释分析。 |
| 外泌体形态鉴定 | 质谱检测总离子流色谱图 |
|---|---|
| 外泌体GO分析 | |
![]() | ![]() |
![]() | ![]() |
| 质谱检测总离子流色谱图 | 上清蛋白GO分析 |
|---|---|
![]() | ![]() |
| 质谱原始数据 | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 鉴定到的蛋白质的识别号 | 蛋白名称的详细描述 | 鉴定到个 | unique肽段数目 | 覆盖率 | 分子量 | 等电点 | 度值 | |||
| Accession | Description | Peptides | Peptide | Coverage | kDa | calc | AbundanOne | AbundanTwo | AbundanThree | AbundanFour |
| A0A061HTB4 | AOA061HTB4 CRIGR | 2 | 2 | 9.59 | 16.44512 | 10.21 | 2 | |||
| A0A061HTF9 | A0A061HTF9 CRIGR | 1 | 3.92 | 22.90616 | 9.73 | 1 | ||||
| A0A061HTV8 | A0A061HTV8 CRIGR | 1.21 | 80.7587 | 6.17 | ||||||
| A0A061HUH1 | AOA061HUH1CRIGR | 6 | 3 | 18.12 | 16.83742 | 4.09 | 5 | 12 | ||
| A0A061HUU1 | A0A061HUU1 CRIGR | 11 | 9 | 8.62 | 68.40173 | 5.03 | 10 | 17 | ||
| A0A061HV56 | A0A061HV56 CRIGR | 1.09 | 88.97694 | 7.99 | ||||||
| A0A061HVT8 | A0A061HVT8 CRIGR | 3 | 3 | 15.86 | 16.0853 | 10.41 | 3 | |||
| A0A061HW82 | A0A061HW82 CRIGR | 1.5 | 116.40916 | 5.78 | ||||||
| A0A061HWC7 | A0A061HWC7 CRIGR | 6 | 6 | 7.06 | 74.72158 | 5.29 | 6 | 6 | ||
| A0A061HWS2 | A0A061HWS2 CRIGR | 8 | 8 | 4.67 | 156.3706 | 8.27 | 10 | 29 | 12 | |
| A0A061HXH9 | A0A061HXH9 CRIGR | 1.14 | 175.96397 | 4.84 | 2 | |||||
| A0A061HXK3 | A0A061HXK3 CRIGR | 8 | 7 | 6.78 | 53.31007 | 5.14 | 27 | |||
| A0A061HYC2 | A0A061HYC2 CRIGR | 3.37 | 33.33812 | 4.38 | ||||||
| A0A061HYZ1 | A0A061HYZ1 CRIGR | 2 | 2 | 6.49 | 25.87677 | 6.43 | 5 | 6 | ||
| A0A061HZ44 | A0A061HZ44 CRIGR | 4.59 | 22.40729 | 5.64 | ||||||
| A0A061HZ51 | A0A061HZ51 CRIGR | 4.65 | 102.38208 | 7.55 | 8 | 13 | ||||
| A0A061HZC1 | A0A061HZC1 CRIGR | 3 | 15.44 | 16.73611 | 7.74 | 4 | 2 | |||
| A0A0611019 | A0A0611019 CRIGR P | 2.8 | 27.88465 | 6.45 | 8 | |||||
| A0A0611041 | A0A061041 CRIGR E | 1.66 | 53.39532 | 6.51 | 5 | 6 | ||||
| A0A0611094 | A0A0611094 CRIGRL | 23 | 6.83 | 205.14667 | 4.86 | 30 | 36 | 44 | ||
| A0A06110G5 | A0A06110G5 CRIGR F | 10.85 | 51.81279 | 4.77 | v | 15 | 17 | |||
| A0A0611130 | A0A0611130 CRIGRH | 3 | 4.05 | 63.28722 | 7.18 | 2 |
| HEATMAP | VOLCANO |
|---|---|
![]() | ![]() |
| KEGG | GO |
|---|---|
![]() | ![]() |
| 目录号 | 服务类型 |
|---|---|
| PA-002-1 | 细胞总蛋白组分析 |
| PA-002-2 | 细胞核蛋白组分析 |
| PA-002-3 | 细胞线粒体蛋白组分析 |
| PA-002-4 | 细胞外泌体蛋白组分析 |
| PA-002-5 | 细胞培养上清蛋白组分析 |