转录组（transcriptome）在广义上是指细胞内全部转录产物的集合，狭义上是指细胞中所有转录本（mRNA）的集合。转录组测序通常来说是指依托于高通量测序平台对细胞中的mRNAs进行测序。经过信息的整理和分析，可在不同的样本中挖掘具有意义的差异表达基因，研究可变剪切，融合基因事件和在转录水平上进行性状定位等。转录组测序现已广泛的应用到科研基础研究，临床疾病研究和药物研发等领域。常规转录组测序根据实验样品的不同可分为真核生物转录组测序和原核生物转录组测序；根据测序物种有无参考基因组可以分为有参基因组转录组测序和无参基因组转录组测序。

技术优势

■ 任意物种检测：不依赖参考基因组，对与有无参考基因组的物种都可以进行转录组测序和后续的生物信息学分析

■ 检测范围广：无需事先了解物种基因信息，可直接对任意物种进行转录组测序。可同时鉴定已知的、稀有低丰度的和新的转录本。

■ 成熟的信息分析：测序数据可以用来分析基因表达差异，进行基因功能富集以及鉴定新转录本信息等。

■ 高分辨率：测序结果精确到单碱基，可以检测到由可变剪切造成的单个碱基差异。